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1．选种及种子灭菌 异地引种和当地选用的种子，应注意从无病区域和无病田块选取，以免带入菌源。同时对种子应进行灭菌处理。采用48℃温水浸种30分钟，及时移入冷水降温，尤其对当年新来收的种子，一定要进行浸种处理灭菌。库存2－3年的种子，虽然带菌率明显降低，但也不应忽视对种子进行处理，以求最佳灭菌效果。
2．轮作栽培 菜根、病残组织、土壤都带菌，因此，应有计划的安排2－3年轮作换茬，以减少初浸染源。
3． 及时清除病残组织 在田间点片发生斑枯病时，应及早摘除病叶，深埋处理。在芹菜移苗和收获田块中，应及时清除病残组织，减少土壤带菌量。
4． 分期播种, 降低发病率 早春芹、春芹、伏芹、秋芹分期播种栽培，有效的躲过发病高峰期,降低发病率，减少菌源。如早芹3月育苗，4月中旬定植，6月上旬收获；春芹4月中旬播种，7月上旬可收获；伏芹在入伏前播种, 9月份收获。
5．大棚芹菜防病管理 近年来大棚芹菜和秋暖畦芹菜面积明显增加，以供应新年、春节需要。在塑料覆盖条件下，湿度明显增大，通风送光条件明显降低，极易发生斑枯病，尤其简易矮棚更易发病。主要防病措施，可采取经常放风降低温度的办法（芹菜可耐低温、不耐高温）可有效控制病情，其次要注意增施磷、钾肥。
6．药剂保护 从株高2-3厘米时开始，每隔7－10天喷布一次1:0.5: 200的波尔多液或75％百菌清500－600倍液。为克服喷药液与增加环境湿度的矛盾，可选用百菌清熏烟法。用75％百菌清粉50克放于小铝盒中，置于酒精炉或煤油灯上加热，靠散发的药雾杀茵，一般每100平方米放置一个。土法搭制的矮棚，药量可减半，从初发病期开始施用，隔7天再熏一次，或直接用百菌清烟雾剂制品（前已有介绍）熏闷。
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