1 抗病育种
1.1 抗枯萎病育种的研究
1.1.1 西瓜枯萎病抗性遗传规律的研究取得新进展
以色列植物病理学家Netzer将高抗品种“卡红”与感病品种Mallali杂交后，进行了抗性遗传研究，结果为枯萎病抗性遗传是受单基因控制的显性遗传，我国周凤珍等也得到了相同的结论。湖南省园艺研究所用瓠瓜DNA导入西瓜选育的两份高抗枯萎病材料与感病品种“蜜宝”杂交进行抗性遗传研究，结果也与周凤珍的完全一致。高抗枯萎病材料与感病品种杂交，其F1代表现高抗，F2代及与感病亲本回交的BCI代群体抗感分离比例符合3：1和1：1的分离规律，表明瓠瓜DNA导入西瓜的枯萎病抗性遗传也是受单基因或单DNA片段控制的显性遗传。以上大量研究结果表明，西瓜枯萎病抗性的遗传是受单基因或单DNA片段控制的显性遗传，利用抗枯萎病材料进行杂交育种可以获得抗枯萎病品种，这为西瓜抗枯萎病育种提供了理论依据，这一研究结果为以后的抗枯萎病育种提供了理论依据。
1.1.2 分子技术在抗枯萎病育种研究中的应用进展
肖光辉等采用生物技术方法首次将瓠瓜DNA导入西瓜，获得了变异性状，并用这些抗性材料为亲本选育出了商品性状优良的3个高抗、2个中抗枯萎病的杂交组合新品系，这表明我国西瓜抗枯萎病育种取得了重大突破。尽管外源DNA直接导入引起的性状变异具有随机性，变异的重现性不高，但若能对控制某一性状的基因进行准确的基因定位，采用转基因技术，将抗枯萎病基因或其它目的基因分离、克隆、经重组构建后导入西瓜，筛选获得带有目的基因并有效表达的转基因西瓜植株，则可实现真正意义上的抗枯萎病性状的定向转移。
肖光辉等用常规育种方法，将野生西瓜的抗枯萎病性状转育到栽培西瓜中，后代在病圃中经7代自交纯化和抗性选择，选育出了4份抗性材料。苗期接种鉴定和自然接种鉴定的结果都表明，选育出的8份材料中，对西瓜枯萎病有2份高抗，6份中抗，对炭疽病的抗性均较强。上述研究结果表明野生西瓜的利用是西瓜抗枯萎病育种的一种有效方法。我国许勇等将西瓜野生种质PI296341抗枯萎病生理小种1的抗性基因连锁的RAPD标记OPP/700进行克隆、测序， Southen杂交证明此标记为1个单拷贝，并转化为SCAR标记，上述技术在抗病转育后代选择中得到了很好的应用，并初步建立了西瓜抗枯萎病育种分子标记辅助选择技术系统。
1.2 抗炭疽病育种
抗炭疽病材料首先是在非洲的一些甜瓜上找到的，南非老乌姆塔利教会的牧师Bush F.Wagener送了5个西瓜品种给D.V.Layton，其中两个品种虽不能食用，但都能抗炭疽病，3个可食用品系与美国品种杂交，F1是抗病的。后来，Norton等于1971年着手培育多抗、优质、高产西瓜新品种，他们将抗炭疽病小种2和抗蔓枯病的PI189225、P1271778分别与抗炭疽病小种1和枯萎病的Jubilee、Crimson Sweet杂交，再经回交、苗期抗性筛选及反复自文选择，育成了抗3种病害的2个品种，使西瓜抗病育种工作迈向一个新的台阶。
西瓜抗炭疽病育种历史已有50多年。其间，育成了多个优良品种，但多为中晚熟类型，多雨潮湿地区若将抗性基因导入早熟材料中，育成抗病优质早熟品种将极富实用价值。我国国内对炭疽病的研究尚少。但是，由于西瓜对炭疽病主要小种的抗性属显性性状，国内广泛开展的杂交育种可以较快地充分利用国外引进的抗病基因库。
2 品质育种
2.1 外观品质
外观品质主要包括果形、皮色、大小及果实整齐度等。近年来，日本、我国台湾和香港等地的市场出现了特小型西瓜。西瓜果皮颜色常见的有黑色、绿色、黄色、花条带等，过去果皮颜色和颜色图案在实际中不太重要，但近些年来，为适应不同消费地区市场的喜好和需求，选育不同皮色的西瓜品种也开始列为西瓜育种目标之一。世界上最早开展黄皮西瓜新品种选育并应用于生产的是我国台湾省农友种苗公司，该公司已选育出二倍体黄皮西瓜“宝冠”和“凤铃”等优良品种，当前黄皮西瓜育种已成为我国西瓜育种的热门话题。
关于西瓜瓤色遗传规律的研究还不够深入，普遍研究认为在西瓜果肉的各种颜色中白色为显性。Elhafezetal研究认为西瓜果肉的瓤色由一对基因控制，显性基因w控制奶黄肉色；显性基因R或隐性基因r控制红肉色，而红色果肉对黄色果肉为显性。Shimotsuma也研究认为西瓜果肉中控制白瓤的基因对红瓤基因表现为显性。另一些学者则研究认为，黄瓤或称“金雀黄”对粉红色表现为显性，深黄瓤对红瓤表现为隐性，而白瓤(或称奶黄瓤)对黄瓤则表现为显性，目前我国已成功培育出了一些黄肉品种西瓜，如黄肉景龙宝等。
2.2 营养及风味育种
对西瓜而言，最重要的营养化学成分是含糖量。美国、日本、韩国及我国台湾省均将折光糖不低于11.5%-12.0%为西瓜育种的品质目标。食用风味品质要求商品西瓜瓜瓤汁多、沙、脆、甜、爽口、口味纯正、肉细、纤维少，另外，西瓜的特殊风味也越来越受到关注。荆杂512是由我国育种专家郑祖兴培育成功的杂交组合奶味西瓜新品种。
改善西瓜品质的栽培措施，主要有在西瓜果实膨大期增施一定量的双氰胺和钾肥可降低果肉中的硝酸盐的含量，并可改善西瓜营养品质，提高果肉中总糖和维生素C 的含量。还有有机肥和无机肥料配合施用较单施化肥能改善西瓜品质的报道。但利用育种手段改善西瓜品质的报道还很少。随着分子标记、分子克隆和转基因技术的不断发展和完善，转基因技术将成为改善西瓜品质的一个重要方法。
3 发展趋势
3.1 品质育种趋向多样化和特色化
3.2 由单抗品种转向多抗品种
3.3 抗病育种兼顾高品质
3.4 在育种方法上采取生物技术和常规育种相结合的方式